BLAST ni algorithm ya kompyuta ambayo inapatikana kwa matumizi mtandaoni katika tovuti ya Kituo cha Kitaifa cha Taarifa ya Bioteknolojia (NCBI), pamoja na tovuti nyingine nyingi. BLAST inaweza kuoanisha kwa haraka na kulinganisha mfuatano wa DNA wa hoja na hifadhidata ya mfuatano, ambayo inafanya kuwa zana muhimu katika utafiti unaoendelea wa jeni.
Je BLAST ni hifadhidata msingi?
BLAST ndiyo programu inayotumika sana katika utafiti wa bioinformatics. Kazi yake kuu ni kulinganisha mfuatano wa mambo yanayokuvutia, mfuatano wa hoja, na mpangilio katika database kubwa BLAST kisha kuripoti zinazolingana bora zaidi, au "vipigo," vinavyopatikana kwenye hifadhidata. Mpango huu rahisi una programu mbili msingi.
Je NCBI ni hifadhidata?
NCBI inahifadhi msururu wa hifadhidata zinazohusiana na teknolojia ya kibayoteknolojia na dawa ya kibayolojia na ni nyenzo muhimu kwa zana na huduma za bioinformatics. Hifadhidata kuu ni pamoja na GenBank ya mfuatano wa DNA na PubMed, hifadhidata ya biblia ya fasihi ya matibabu. Hifadhidata zingine ni pamoja na hifadhidata ya NCBI Epigenomics.
Je BLAST inaajiriwa katika hifadhidata za NCBI pekee?
BLAST inapatikana kwenye wavuti kwenye tovuti ya NCBI. Aina tofauti za BLAST zinapatikana kulingana na mfuatano wa hoja na hifadhidata lengwa.
Hifadhi hifadhidata ya BLAST inafanyaje kazi?
BLAST inafanya kazi vipi? BLAST hutambua mfuatano wenye kufanana kwa kutumia mbinu ya kiheuristic ambayo mwanzoni hupata ulinganifu mfupi kati ya mifuatano miwili; kwa hivyo, njia haizingatii nafasi nzima ya mlolongo. Baada ya mechi ya kwanza, BLAST inajaribu kuanzisha upangaji wa eneo kutoka kwa mechi hizi za mwanzo.
