Muundo wa Homolojia hupata muundo wa miraba mitatu ya protini lengwa kulingana na ufanano kati ya kiolezo na mfuatano lengwa na mbinu hii inathibitisha kuwa ya ufanisi linapokuja suala la kusoma protini za utando ambazo ni ngumu kung'aa kama GPCR kwani hutoa kiwango cha juu cha uelewa wa …
Muundo wa homolojia ni nini na kwa nini unahitajika?
1.2.
Muundo wa Homolojia ni njia sahihi zaidi ya ukokotoaji ili kuunda miundo ya miundo inayotegemeka na hutumiwa sana katika matumizi mengi ya kibiolojia. Muundo wa Homolojia hutabiri muundo wa 3D wa protini ya hoja kupitia mpangilio wa mfuatano wa violezo vya protini.
Kanuni ya Uundaji wa Homolojia ni nini?
Muundo wa Homolojia pia hujulikana kama uundaji linganishi hutabiri miundo ya protini kulingana na mfuatano wa homolojia na miundo inayojulikana. Inatokana na kanuni kwamba “ ikiwa protini mbili zina uwiano wa juu wa kutosha wa mfuatano, kuna uwezekano wa kuwa na miundo ya pande tatu zinazofanana.”
Ni nini hufanya Muundo mzuri wa homolojia?
Tukifafanua "muundo wa homolojia uliofanikiwa sana" kama ule ulio na <=2 Å rmsd kutoka kwa muundo wa majaribio, basi kiolezo lazima kiwe na >=60% ya utambulisho wa mfuatano kwa lengo la mafanikio. kiwango >70% Hata katika utambulisho wa mfuatano wa juu (60% -95%), kama modeli moja kati ya kumi za homolojia zina rmsd >5 Å vs.
Ni lipi kati ya zifuatazo ambalo ni kweli kuhusu Uundaji wa Homolojia?
Maelezo: Kama jina linavyopendekeza, uundaji wa homolojia hutabiri muundo wa protini kulingana na mfuatano wa homolojia na miundo inayojulikana Muundo wa Homolojia hutoa muundo wa atomi zote kulingana na upatanishi wa violezo vya protini.… Hitilafu zilizofanywa katika hatua ya upangaji haziwezi kusahihishwa katika hatua zifuatazo za uundaji.