Asidi zote za amino zinapatikana katika α-heli, lakini glycine na proline sio kawaida, kwani huharibu α-helix. Glycine imeondolewa kwenye vizuizi vingi vya steric kwa sababu haina β kaboni. … Proline, kwa upande mwingine, ni ngumu sana.
Amino asidi gani haipatikani kwenye heli za alpha?
Proline haipatikani katika muundo wa alfa helical wa protini, kwa kuwa ina muundo maalum wa mzunguko (ni asidi ya imino sio asidi ya amino)m aina hii ya muundo wa pili ina upana maalum na idadi maalum ya mabaki ya amino asidi / zamu. Kwa hivyo proline inachukuliwa kama kivunja helical cha alpha.
Kwa nini glycine ni kivunja alpha helix?
Proline na glycine wakati mwingine hujulikana kama "helix breakers" kwa sababu huharibu utaratibu wa upatanisho wa α wa uti wa mgongo; hata hivyo, wote wawili wana uwezo usio wa kawaida wa upatanishi na kwa kawaida hupatikana kwa zamu.
glycine iko wapi kwenye alpha helix?
Kuna nafasi tatu katika motifu ya helix–turn–helix ambazo zimehifadhiwa sana. Alanini kawaida hupatikana katika nafasi ya 5 ndani ya α hesi ya kwanza; glycine inapatikana kwenye nafasi 9, nafasi ya kwanza ya zamu; na valine au isoleusini kwa kawaida hupatikana katika nafasi ya 15 ndani ya α hesi ya pili.
Je, mabaki ya glycine hupatikana kwa wingi kwenye helikopta za alpha?
Glycine, pamoja na miunganisho yake mingi ya msingi, ni pia haipatikani kwa heli. Kujua uwezekano wa asidi ya amino kutokea katika alpha helix (kinachojulikana kama mielekeo ya helix), inawezekana kutabiri mahali ambapo heliksi hutokea katika mfuatano wa protini.
